單細胞免疫組庫

免疫組庫（Immune Repertoire，IR）是B/T淋巴細胞抗原受體多樣性檢測，即BCR/TCR的多樣性。BCR和TCR一般由可變區(V區)、多變區(D區)、連接區(J區)、恒定區(C區)構成, V(D)J區域在遺傳過程中發生重排或重組，形成大量不同的組合形式，導致BCR和TCR基因序列多樣性極其豐富，這些序列多樣性集合稱為免疫組庫。

單細胞免疫組庫測序（scVDJ-seq ）是基于10x Genomics平臺的微流控和油滴包裹技術，在單細胞水平同時檢測轉錄組基因表達和TCR/BCR多樣性，不但可以了解TCR/BCR克隆型，還可以聯合轉錄組數據深入挖掘生命機理，為免疫組學研究提供更高效的平臺，在腫瘤微環境、感染性疾病、自身免疫疾病等研究領域有著廣泛的應用前景。

利用10× Genomics平臺完成單細胞的分離、反轉錄成cDNA后，將cDNA一分為二，同時進行TCR/BCR的V(D)J建庫和5’單細胞轉錄本建庫，并連接測序引物，獲得每個細胞5’基因表達數據和V(D)J全長序列信息，獲得數據進行細胞亞群聚類、細胞表達特征、標記分子篩選、免疫組庫克隆型等分析。

百邁客推出10x genomics 單細胞免疫組庫升級版2.0，使用chipK芯片和dual index，全新體驗，性能更優。

乳腺腫瘤微環境中多種免疫表型的單細胞圖譜

了解腫瘤微環境中免疫細胞的表型，對于癌癥進展和免疫治療反應的研究至關重要。研究者使用單細胞RNA測序分析了來自8位原發性乳腺癌患者的45,000個免疫細胞，觀察到正常免疫細胞與腫瘤組織中免疫細胞之間有顯著相似性，但后者針對腫瘤微環境出現特異性連續表型擴展；并通過單細胞免疫組庫測序檢測另外27,000個T細胞轉錄組基因表達和T細胞受體（TCR）多樣性，結果揭示了TCR組合使用對表型多樣性的影響。單細胞免疫組庫和單細胞RNA數據聯合分析更有利于研究腫瘤微環境、尋找免疫治療的靶點，輔助腫瘤診療。